Vanaf de oprichting in 1985 tot aan 1990 was zij als stafmedewerkster deskundigheids-bevordering verbonden aan de Stichting Handen Thuis, het landelijke – door de Nederlandse overheid gesubsidieerde - expertisebureau inzake ongewenste intimiteiten op het werk. Daarna bracht Alie Kuiper haar deskundigheid onder in een eigen bureau. Met ingang van 1993 werd de reeds langer bestaande samenwerking met drs. Willeke Bezemer omgezet in een partnerschap en werd het bureau Bezemer & Kuiper opgericht.

Alie Kuiper heeft zowel nationaal als internationaal meegewerkt aan diverse onderzoeken, publicaties en congressen over ongewenste omgangsvormen op het werk. Zo organiseerde zij in opdracht van de Europese Unie en de Nederlandse overheid een Europees congres over de aanpak van ‘sexual harassment at work’. Ook was zij in opdracht van de SER medeproducent van het voorlichtingspakket voor bedrijven ‘Ongewenst Intiem’.

Voor de ILO verrichtte Alie Kuiper verschillende werkzaamheden zoals het opstellen van een rapportage en het verzorgen van presentaties en workshops op een congres in Manilla voor landen in Zuidoost Azië over de problematiek van seksuele intimidatie.Voor de OVSE verzorgde zij als key-note speaker en presentatie over een effectieve aanpak van ‘harassment at work: the Dutch approach’.